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Bioécologie

Articles avec #livres - revues - theses - rapports...

France : libre accès aux articles scientifiques !

21 Octobre 2016,

Publié par Bioécologie

La loi pour une République numérique promulguée le 8 octobre 2016 comporte un article dédié au libre accès aux articles scientifiques, l’article 30.

En bref, tous les articles scientifiques issus de la recherche publique peuvent désormais être déposés dans HAL :

  • dans leur version manuscrit accepté,

  • avec un embargo maximum de 6 mois,

quelle que soit la politique de libre accès de l’éditeur.

Le manuscrit accepté correspond au manuscrit auteur de la version définitive de l’article, sans la mise en forme typographique de l’éditeur ni les mentions de copyright.

Extrait de l’article 30 de la loi pour une République numérique, dont l’intégralité est disponible sur Legifrance :

« Lorsqu'un écrit scientifique issu d'une activité de recherche financée au moins pour moitié par des dotations de l'Etat, des collectivités territoriales ou des établissements publics, par des subventions d'agences de financement nationales ou par des fonds de l'Union européenne est publié dans un périodique paraissant au moins une fois par an, son auteur dispose, même après avoir accordé des droits exclusifs à un éditeur, du droit de mettre à disposition gratuitement dans un format ouvert, par voie numérique, sous réserve de l'accord des éventuels coauteurs, la version finale de son manuscrit acceptée pour publication, dès lors que l'éditeur met lui-même celle-ci gratuitement à disposition par voie numérique ou, à défaut, à l'expiration d'un délai courant à compter de la date de la première publication. Ce délai est au maximum de six mois pour une publication dans le domaine des sciences, de la technique et de la médecine et de douze mois dans celui des sciences humaines et sociales. »

Un autre article de cette loi concerne également le libre accès, l’article 38 sur la fouille de textes et de données. Il sera effectif lorsque les décrets d’application auront été publiés.

Source : Bibliothèque universitaire Pierre et Marie Curie (France)

France : libre accès aux articles scientifiques !

The European amphioxus (Branchiostoma lanceolatum)

7 Octobre 2016,

Publié par Bioécologie

Insights into spawning behavior and development of the European amphioxus (Branchiostoma lanceolatum).

Fuentes M1, Benito E, Bertrand S, Paris M, Mignardot A, Godoy L, Jimenez-Delgado S, Oliveri D, Candiani S, Hirsinger E, D'Aniello S, Pascual-Anaya J, Maeso I, Pestarino M, Vernier P, Nicolas JF, Schubert M, Laudet V, Geneviere AM, Albalat R, Garcia Fernandez J, Holland ND, Escriva H.

1Laboratoire Arago, UMR7628 CNRS, University Pierre and Marie Curie-Paris6 Banyuls sur Mer, F-66650, France.
Abstract

The cephalochordate amphioxus (Branchiostoma sp.) is an important animal model for studying the evolution of chordate developmental mechanisms. Obtaining amphioxus embryos is a key step for these studies. It has been shown that an increase of 3-4 degrees C in water temperature triggers spawning of the European amphioxus (Branchiostoma lanceolatum) in captivity, however, very little is known about the natural spawning behavior of this species in the field. In this work, we have followed the spawning behavior of the European amphioxus during two spawning seasons (2004 and 2005), both in the field and in captivity. We show that animals in the field spawn approximately from mid-May through early July, but depending on the year, they show different patterns of spawning. Thus, even if temperature has a critical role in the induction of the spawning in captivity, it is not the major factor in the field. Moreover, we report some improvements on the methodology for inducing spawning in captivity (e.g. in maintenance, light cycle control and induction of spawning in a laboratory without running sea water system). These studies have important implications for amphioxus animal husbandry and for improving laboratory techniques to develop amphioxus as an experimental animal model.

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TERMIUM : la banque de données terminologiques et linguistiques du gouvernement du Canada.

21 Juillet 2016,

Publié par Bioécologie

TERMIUM Plus®, une des plus grandes banques de données terminologiques et linguistiques dans le monde, vous donne accès à des millions de termes en anglais, français, espagnol et portugais. Vous pouvez trouver des termes, des abréviations, des définitions et des exemples d’utilisation dans un large éventail de domaines spécialisés. La banque de données est un outil essentiel pour décoder les acronymes, vérifier un titre officiel, trouver un équivalent dans une autre langue et bien plus encore.

TERMIUM : la banque de données terminologiques et linguistiques du gouvernement du Canada.

Fly Pushing: The Theory and Practice of Drosophila Genetics

15 Juin 2016,

Publié par Bioécologie

A second edition of the classic handbook has become a standard in the Drosophila field. This edition is expanded to include topics in which classical genetic strategies have been augmented with new molecular tools. Included are such new techniques as homologous recombination, RNAi, new mapping techniques, and new mosaic marking techniques.

Fly Pushing: The Theory and Practice of Drosophila Genetics

The best books on Biology - Top 5!

20 Mai 2016,

Publié par Bioécologie

Sean B Carroll recommends the best books on Biology.

What do molecules in a cell have in common with lions in the Serengeti? They all follow rules, says scientist and author Sean B. Carroll. He chooses the best books on the science of life at all scales, from the death of the dodo to the discovery of DNA.

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Multiple genetic changes underlie the evolution of long-tailed forest deer mice

19 Mai 2016,

Publié par Bioécologie

Evan P Kingsley, Krzysztof M Kozak, Susanne Pfeifer, Dou-Shuan Yang, Hopi E Hoekstra

doi: http://dx.doi.org/10.1101/041699

Abstract

Understanding both the role of selection in driving phenotypic change and its underlying genetic basis remain major challenges in evolutionary biology. Here we focus on a classic system of local adaptation in the North American deer mouse, Peromyscus maniculatus, which occupies two main habitat types, prairie and forest. Using historical collections we demonstrate that forest-dwelling mice have longer tails than those from non-forested habitats, even when we account for individual and population relatedness. Based on genome-wide SNP capture data, we find that mice from forested habitats in the eastern and western parts of their range form separate clades, suggesting that increased tail length evolved independently from a short-tailed ancestor. Two major changes in skeletal morphology can give rise to longer tails--increased number and increased length of vertebrae--and we find that forest mice in the east and west have both more and longer caudal vertebrae, but not trunk vertebrae, than nearby prairie forms. Using a second-generation intercross between a prairie and forest pair, we show that the number and length of caudal vertebrae are not correlated in this recombinant population, suggesting that variation in these traits is controlled by separate genetic loci. Together, these results demonstrate convergent evolution of the long-tailed forest phenotype through multiple, distinct genetic mechanisms (controlling vertebral length and vertebral number), thus suggesting that these morphological changes--either independently or together--are adaptive.

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3 Mai 2016,

Publié par Bioécologie

Transgenerational Epigenetic Contributions to Stress Responses: Fact or Fiction?

30 Mars 2016,

Publié par Bioécologie

Author: Nestler EJ (2016), PLoS Biol 14(3): e1002426. doi:10.1371/journal.pbio.1002426

Abstract

There has been increasing interest in the possibility that behavioral experience—in particular, exposure to stress—can be passed on to subsequent generations through heritable epigenetic modifications. The possibility remains highly controversial, however, reflecting the lack of standardized definitions of epigenetics and the limited empirical support for potential mechanisms of transgenerational epigenetic inheritance. Nonetheless, growing evidence supports a role for epigenetic regulation as a key mechanism underlying lifelong regulation of gene expression that mediates stress vulnerability. This Perspective provides an overview of the multiple meanings of the term epigenetic, discusses the challenges of studying epigenetic contributions to stress susceptibility—and the experimental evidence for and against the existence of such mechanisms—and outlines steps required for future investigations.

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Chromatin structure and histone modifications at N-terminal histone tails.

Chromatin structure and histone modifications at N-terminal histone tails.