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Bioécologie

Articles avec #cours...

Enseignements de Statistique en Biologie

24 Mars 2017,

Publié par Bioécologie

Fondateurs

A.B. Dufour, D. Chessel, J.R. Lobry

Contributeurs

M. Bailly-Bechet, S. Dray, S. Mousset,
J. Thioulouse

Ingénieurs

S. Penel et A. Siberchicot

Notes de cours, illustrations, exercices, problèmes, fiches de Travaux Dirigés
Jeux de données pour la pratique de la statistique

 

euclidien
gros

Avec la participation de

Biodiversité continentale : rivières et forêts

19 Septembre 2015,

Publié par Bioécologie

Biodiversité continentale : rivières et forêts

Dans cette troisième semaine de cours, partez à la découverte de la biodiversité des milieux terrestres et aquatiques continentaux. Il s'agit de milieux extrêmement diversifiés et faisant l'objet de dynamiques tout à fait spécifiques, à l'image des rivières intermittentes ou des successions écologiques des milieux forestiers. Ces milieux constituent également des trames, dont certaines présentent d'importantes variations physico-chimiques, à l'image des rivières de la source à l'estuaire. La biodiversité y est très riche et plusieurs perspectives de préservation vous sont présentées.

Course: "Experimental evolution: theory and current practices”

23 Juillet 2015,

Publié par Bioécologie

The International Graduate Program in Life Sciences and the Interdisciplinary Master in Life Sciences (IMaLis) are now accepting applications for the course "Experimental evolution: theory and current practices”, to be held at the Institute of Biology of the École Normale Supérieure (IBENS), in Paris, November 9-13, 2015.

The course will introduce Master and PhD students in Evolutionary Biology to the experimental approaches employed to test theory. It will bring together world-renowned researchers to lecture on topics including the historical development of experimental evolution, experimental design, the evolution of sexuality, origin of multicellularity and sociality, the genetic basis of adaptation to novel environments, etc.

Lectures will be complemented with computer projects on the analysis of population genomics data.

The course will be restricted to a maximum of 10 students. Meal and accommodation costs will be covered and there is no registration fee.

Upon successful completion of the course, European students will be awarded 6 ECTS.

Faculty: Charlie Baer (University of Florida U.S.A.); Ivo Chelo (Instituto Gulbenkian de Ciência Portugal) ; Antony Dean (University of Minnesota U.S.A.); Marie-Anne Félix (IBENS) ; Regis Ferrière (IBENS); Duncan Greig (Max Planck Institute for Evolutionary Biology Germany), Thiago Guzella (IBENS); Philippe Nghe (ESPCI France); Paul Rainey (Institute for Advanced Study New Zealand); Christian Schlötterer (Institut für Populationsgenetik Austria); Olivier Tenaillon (Université Paris 7 France); Henrique Teotónio (IBENS); Arjan de Visser (Wageningen UR The Netherlands).

Sponsoring and partner graduate programs: Centre National de la Recherche Scientifique, ENS, Paris Sciences et Lettres, Partner University Fund – French American Cultural Exchange, Vienna Graduate School of Population Genetics.

We will receive applications until October 5, 2015. Applicants should send a letter of motivation and CV as a PDF file to: teotonio@biologie.ens.fr.

We also welcome participants at any stage of their careers to attend the lectures. Meals and accommodation costs will not be covered in this case. Registration is required by sending an email to: teotonio@biologie.fr. We will accept applications on a first come first serve basis, to a maximum of 35.

Further information and updates can be found at http://www.gradprog.biologie.ens.fr/.

Course: "Experimental evolution: theory and current practices”

Introduction à la statistique avec R : des cours gratuits

27 Mars 2014,

Publié par Bioécologie

Introduction à la statistique avec R : des cours gratuits

Grâce à la plateforme FUN de MOOC (Massive Open Online Courses, en français « Cours en ligne ouverts à tous ») lancé par le Ministère français de l’Enseignement Supérieur et de la Recherche en octobre 2013, accédez gratuitement à ce cours pour apprendre la statistique à l’aide du logiciel libre R.

Par : Bruno Falissard, Christophe Lalanne, Université Paris Sud

Ce cours permet d’apprendre la statistique à l’aide du logiciel libre R. Le recours aux mathématiques est minimal. L’objectif est de savoir analyser des données, de comprendre ce que l’on fait, et de pouvoir communiquer ses résultats.

Présentation du cours :

Le recours aux mathématiques est minimal. L’objectif est de savoir analyser des données, de comprendre ce que l’on fait, et de pouvoir communiquer ses résultats.

Ce cours s’adresse aux étudiants et praticiens de toutes disciplines qui recherchent une formation pratique. Il sera utile à toute personne ayant le besoin d’analyser un jeu de données réel dans le cadre d’un enseignement, de son activité professionnelle ou de recherche, ou par simple curiosité d’analyser un jeu de données par soi-même (données du web, données publiques…).

Le cours s’appuie sur le logiciel libre R qui est un des logiciels de statistique les plus puissants disponibles actuellement.

Les méthodes abordées sont : les techniques descriptives, les tests, l’analyse de variance, les modèles de régression linéaire et logistique, les données censurées (de survie).

Pour plus d'informations et accéder gratuitement à ce cours en ligne, cliquez ici.

Attention : pour suivre ces cours, il est nécessaire de s'inscrire (fin des inscriptions : 11 mai 2014). Les cours débuteront le 13 avril 2014, jusqu'au 11 mai 2014.

Remarque : tous les cours présents sur FUN sont conçus par des professeurs d’universités et écoles françaises et leurs partenaires académiques internationaux. Les étudiants et les internautes peuvent suivre ces cours de manière interactive et collaborative, à leur rythme.

Ci-dessous, la présentation du cours en vidéo :

PhD course in Aquatic Microbial Molecular Ecology

13 Janvier 2014,

Publié par Bioécologie

PhD course in Aquatic Microbial Molecular Ecology

PhD course in Aquatic Microbial and Molecular Ecology (University of Southern Denmark) during the first 3 weeks of August 2014 is now open for applications.

The focus in the course is to provide a mixture of theory and laboratory work, with focus on state-of-the-art methods used in ecological, biogeochemical and molecular studies of aquatic sediments. You can find more information about the course in the attached file and at the course website.

The application form can be downloaded from the website. There is no strict application deadline, but it will appreciate receiving applications before 15 May, 2014.

Workshop on modelling individual histories with state uncertainty

3 Décembre 2012,

Publié par JMB

Upcoming workshop on the analysis of capture-recapture data using multievent models to be held at Center for Evolutionary and Functional Ecology (CEFE), Montpellier, France, 18-22 March 2013. The registration of participants will be at CEFE the 18 March on evening and will be followed by 3 days of lectures and practical exercises plus 1 day of practical work on the participants' data.

You are hereby cordially invited to take part in the following workshop organized by the Biostatistics and Population Biology team of CEFE in Montpellier (France). For application, go to here.


Corse Mai 2009 175The estimation of population parameters (survival, recruitment, dispersal, and population growth rate) is critical to many areas of fundamental and applied biology. The major source of data for such estimation comes from observations of marked animals. This workshop will deal with recent advances in the analysis of such data. The content is aimed at providing the participants with a solid background in the philosophy, theory and practices for the analysis of data from marked animals, with a specific focus on multievent data and models. Multievent capture-recapture models are a natural generalization of the multisite recapture models. Similarly, individuals are sampled on discrete occasions, at which they may be captured or not. However, contrary to the multisite case, uncertainty in the assessment of state such as breeder, diseased or highly catchable can be incorporated into the analysis. Conceptually, it is not states that are observed but rather something dubbed an "event" (a particular breeding behaviour, a positive blood test or just encounter), which reflects to some extent the underlying state. The presence of imperfect observations and the lack of information on individual quality presently make multievent models an invaluable tool in virtually any area of population biology. Current applications include the study of dispersal, epidemiology, individual heterogeneity, mixture of information... New developments allow the treatment of individual heterogeneity through random effects as well as through mixture models, and the inclusion of individual as well as environmental covariates.

Emphasis will be placed on stringent procedures for building and selecting the most appropriate models for the data set at hand, in order to be able to draw reliable biological conclusions. Format of the workshop will be a combination of lectures and computer lab exercises with the programs E-SURGE and U-CARE. U-CARE incorporates goodness-of-fit tests for multistate models, and E-SURGE makes the building of complex models easy based on a language describing the structure of models in a compact and user-friendly way. All lectures and course material will be in English.

It is our hope that participants will bring their own capture-recapture data to work on them during the workshop. To take full advantage of the workshop, it is expected that the participants will have some basic practice of the analysis of CR data.

Participants will have to provide their own laptop computer that is capable of running Windows-based software.

Thank you for disseminating this message to colleagues and students who may not have received it.

Organisers: Roger Pradel, Rémi Choquet, Olivier Gimenez, Jean-Dominique Lebreton, Gilles Gauthier, Guillaume Souchay and Louise Van Oudenhove.

La banque des savoirs

1 Novembre 2011,

Publié par JMB

La Banque des savoirs, créée par le Conseil général de l'Essonne (France), est un site de vulgarisation scientifique et technique pour le grand public ouvert en 2004. Il a pour vocation de rendre les savoirs accessibles à tous grâce au soutien d'experts reconnus, de faire découvrir la recherche scientifique et ses métiers, de valoriser les actions de culture scientifique et technique et de favoriser le débat sur des questions scientifiques et éthiques.