Overblog Suivre ce blog
Administration Créer mon blog
Bioécologie

Articles avec #universites - laboratoires... : focus !

The eDNA platform

6 Avril 2017,

Publié par Bioécologie

This technical platform has been set up to allow ecologists to perform large-scale analysis of environmental DNA via a metabarcoding approach. DNA metabarcoding refers to high throughput DNA-based identification of multiple species from environmental DNA. The main applications consist in diet analysis from feces, in biodiversity assessment using soil or water samples, and in palaeo-environment reconstruction using lake sediments and permafrost samples.

The eDNA platform is composed of three pre-PCR extraction rooms dedicated to feces, soil, and ancient DNA, and to several post-PCR rooms dedicated to the purification and the titration of PCR products. The next generation sequencing on Illumina platforms (HiSeq or MiSeq) is outsourced.

The eDNA platform

Le Centre de Synthèse et d'Analyse sur la Biodiversité (CESAB)

14 Mars 2017,

Publié par Bioécologie

Le CESAB invite à une nouvelle façon de faire de la recherche sur la biodiversité en exploitant mieux les données et les informations existantes. Il accueille dans ses locaux des groupes de chercheurs pour des sessions de travail qui s’inscrivent dans la durée.

La biodiversité est un domaine de recherche qui demande la mobilisation d’importants jeux de données collectés dans différents lieux, à différentes échelles, sur différentes variables : distribution des espèces, suivi dans le temps, données biologiques, climatiques, socio-économiques, télédétection, etc. Cependant, la réponse à certaines questions nécessite de rassembler cette multitude d’informations qui dépassent souvent les jeux de données collectés à l’issue de travaux individuels ou de programmes de recherche limités dans le temps. Le potentiel d’analyses nouvelles et de synthèse des données acquises lors de ces études diverses et non coordonnées reste ainsi largement sous-exploité.

Le Centre de Synthèse et d'Analyse sur la Biodiversité (CESAB)

The Lizard Lab - Macquarie University (Sydney, Australia)

28 Juillet 2014,

Publié par Bioécologie

The lizard lab: "We investigate the behaviour, ecology and evolution of lizards. In addition to lizards, we are currently working on tree frogs and cane toads and have previously worked on snakes, mole-rats and Malawi cichlids. We are part of the Department of Biological Sciences, within the Division of Brain, Behaviour and Evolution at Macquarie University. Take a look at our research to find out the specific details of what we do."

Augrabies flat lizard (Platysaurus broadleyi). © Martin Whiting

Augrabies flat lizard (Platysaurus broadleyi). © Martin Whiting

L’Herbier du Muséum National d’Histoire Naturelle

29 Novembre 2013,

Publié par Bioécologie

L’Herbier du Muséum National d’Histoire Naturelle

Partez à la découverte de ce merveilleux herbier (Paris, France).

A travers 40 web-documentaires, suivez quatre ans de travaux de rénovation, découvrez des collections botaniques exceptionnelles et des hommes et des femmes qui chaque jour font vivre ces lieux (photo de Carlos Munoz Yague).

Bonne visite, c'est ici

Un nouveau laboratoire de recherche : "Protection humaine et réponse au désastre" à Fukushima

24 Octobre 2013,

Publié par Bioécologie

Un nouveau laboratoire de recherche : "Protection humaine et réponse au désastre" à Fukushima

Un communiqué de presse du CNRS, Paris, 11 octobre 2013

Le CNRS a créé le 4 octobre 2013 un Laboratoire international associé (LIA) consacré à la protection humaine et à la réponse au désastre à Fukushima, en partenariat avec le ministère des Affaires étrangères, l'université Lille 1 Sciences et technologies, l'université de Fukushima et l'université Doshisha à Kyoto.

Les membres de ce LIA sont le Bureau français de la Maison franco-japonaise (Ministère des Affaires étrangères/CNRS), le Centre lillois d'études et de recherches sociologiques et économiques (CLERSE, CNRS/Université Lille 1 Sciences et technologies), le FUkushima FUture Center for REgional Revitalization (FURE Center) de l'université de Fukushima et la Graduate School of Global Studies de l'université Doshisha à Kyoto.

Depuis l'accident de Fukushima, ces quatre partenaires menaient une réflexion commune sur la notion de sécurité humaine : leurs chercheurs étudiaient le rôle et la responsabilité de la science dans l'analyse des enjeux de la situation, la gestion du désastre, les conséquences économiques, sociales, sanitaires et morales pour les populations.

En créant un LIA, ils souhaitent désormais confronter leurs approches et approfondir leurs recherches socio-économiques, épistémologiques et politiques autour de deux axes de recherche :

- Protection et vulnérabilité : politiques publiques et variétés des réponses au désastre
Etudier s'il est encore possible de concevoir et mettre en œuvre une protection humaine en situation de vulnérabilité en profondeur, en matière de logement, d'indemnisation, d'incitation au retour…

- Savoirs, société et démocratie après Fukushima
Etudier la place de l'information et des savoirs dans la société nucléaire, mettre en évidence l'articulation entre information/savoirs et protection humaine, réfléchir aux processus de production d'ignorance et à la soustraction des réalités du nucléaire à la connaissance publique, étudier l'impact d'une telle soustraction sur une nouvelle définition "insécuritaire" de la connaissance

Pour mener les recherches autour de ces deux axes, le LIA rassemble des spécialistes japonais et français des sciences humaines et sociales du nucléaire et ouvre le dialogue vers d'autres disciplines telles que l'ingénierie, la santé et l'agronomie. Le LIA est dirigé par Thierry Ribault (CNRS), chercheur au CLERSE.

Lire la suite ici

Aquarius: The undersea laboratory

2 Juin 2013,

Publié par Bioécologie

Aquarius: The undersea laboratory

Just off the coast of Florida, 17 metres below the surface, lies Aquarius - the world's only operating undersea laboratory. Scientists can live in Aquarius for up to two weeks, giving them plenty of time to study the coral reef community. But with budget struggles ahead, the US Congress may withdraw funding for the lab. Mark Schrope dived down to meet the researchers who are trying to save this iconic underwater base.

Read the Nature News story: End of an age for Aquarius

Go to the Aquarius homepage

Nature (International weekly journal of Science), 01 August 2011

Eco Evolutionary Mathematics

4 Février 2010,

Publié par JMB

Home image
The Eco Evolutionary Mathematics unit links mathematicians and biologists in the study of the interactions between the stochasticity of individual-level processes and non-linear population-level feedbacks. It is well-known that demographic variability and population genetics profoundly affect the structure and dynamics of the environment, from single populations to the community of interacting species. At the same time, the dynamics of the environment produces the signals that individuals respond to as well as the selective pressures experienced by successive generations. This feedback between individuals and their environment is studied using new mathematical approaches. The modeling techniques that this gives rise to can be applied to a vast range of applications, which the EEM unit explores in a number of directions: the evolution of biodemographical strategies and their plasticity, the evolution of the cooperation and interspecific mutualisms. the evolution of host-parasite interactions, the non-linear dynamics of invasions and epidemics, the dynamics of small populations and the prediction of extinction risk.

Barn Swallow Research

30 Janvier 2010,

Publié par JMB

Barn-Swallow.jpgHirundo rustica.com : "We are a group of scientists who have studied barn swallows in parts of Europe, Africa and North America during the last 20 years. We have used barn swallows to investigate numerous ideas in ecology and evolution, with a particular emphasis on sexual selection.

This website provides a summary of our
research, as well as a complete list of our scientific publications on barn swallows, and our names and contact details." (photo: Barn Swallow - Hirundo rustica - © AJ Hand)

More informations here

Chernobyl Research Initiative - University of South Carolina

30 Janvier 2010,

Publié par JMB

Moller-and-Mousseau-at-Chernobyl.jpgSince 1998, University of South Carolina (USC) has sponsored research related to the long term ecological and health consequences of the radioactivitie contaminants that were dispersed over vast expanses of Europe in 1986. This research is important for the understanding of long term consequences of radiation for ecosystem and human health. 
(photo: Measuring a barn swallow's famoulsy elongated tail near Chernobyl in Ukraine. Anders Pape Moller and Tim Mousseau)  

More informations here

Le laboratoire d’écologie historique et de dendrochronologie (Québec, Canada)

2 Novembre 2009,

Publié par JMB

Le laboratoire d’écologie historique et de dendrochronologie de l’Université du Québec à Rimouski (UQAR) s’intéresse à la dynamique à long terme des écosystèmes et des paysages forestiers pour isoler et comprendre les effets des changements climatiques et des perturbations naturelles (incendies, épidémies) et anthropiques (coupes forestière, colonisation). Les principales approches sont la dendrochronologie (analyse de l’information historique, écologique et climatique attachée aux cernes annuels de croissance des arbres) et l’analyse d’archives historiques, notamment les archives de l’arpentage primitif du Québec. Les résultats de recherche fournissent des référentiels pour aider à aménager les forêts. Le travail est réalisé dans la forêt tempérée nordique et dans la forêt boréale, principalement dans la taïga.