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Bioécologie

La plateforme GenoSol

6 Avril 2017,

Publié par Bioécologie

La plateforme GenoSol de l’UMR Agroécologie de l’INRA de Dijon est une structure unique en Europe, centrée sur la (micro)biologie des sols. Ses missions s’articulent autour de trois activités principales : un Conservatoire des Ressources Génétiques Microbiennes, une Plateforme Technique de caractérisation moléculaire du métagénome microbien, un Système d’Information sur la diversité microbienne des sols et de l’environnement. Depuis 2015, la Plateforme GenoSol est certifiée ISO 9001 pour le Conservatoire des Ressources Génétiques Microbiennes.

La plateforme GenoSol

The eDNA platform

6 Avril 2017,

Publié par Bioécologie

This technical platform has been set up to allow ecologists to perform large-scale analysis of environmental DNA via a metabarcoding approach. DNA metabarcoding refers to high throughput DNA-based identification of multiple species from environmental DNA. The main applications consist in diet analysis from feces, in biodiversity assessment using soil or water samples, and in palaeo-environment reconstruction using lake sediments and permafrost samples.

The eDNA platform is composed of three pre-PCR extraction rooms dedicated to feces, soil, and ancient DNA, and to several post-PCR rooms dedicated to the purification and the titration of PCR products. The next generation sequencing on Illumina platforms (HiSeq or MiSeq) is outsourced.

The eDNA platform

Re-evaluation of learned information in Drosophila

5 Avril 2017,

Publié par Bioécologie

  • Johannes Felsenberg
  • Oliver Barnstedt
  • Paola Cognigni
  • Suewei Lin 
  • Scott Wadde
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