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Bioécologie

FishBase: A Global Information System on Fishes

24 Octobre 2016,

Publié par Bioécologie

FishBase is a relational database with information to cater to different professionals such as research scientists, fisheries managers, zoologists and many more.  FishBase on the web contains practically all fish species known to science.

FishBase was developed at the WorldFish Center in collaboration with the Food and Agriculture Organization of the United Nations ( FAO) and many other partners, and with support from the European Commission ( EC). Since 2001 FishBase is supported by a consortium of nine research institutions

FishBase: A Global Information System on Fishes

France : libre accès aux articles scientifiques !

21 Octobre 2016,

Publié par Bioécologie

La loi pour une République numérique promulguée le 8 octobre 2016 comporte un article dédié au libre accès aux articles scientifiques, l’article 30.

En bref, tous les articles scientifiques issus de la recherche publique peuvent désormais être déposés dans HAL :

  • dans leur version manuscrit accepté,

  • avec un embargo maximum de 6 mois,

quelle que soit la politique de libre accès de l’éditeur.

Le manuscrit accepté correspond au manuscrit auteur de la version définitive de l’article, sans la mise en forme typographique de l’éditeur ni les mentions de copyright.

Extrait de l’article 30 de la loi pour une République numérique, dont l’intégralité est disponible sur Legifrance :

« Lorsqu'un écrit scientifique issu d'une activité de recherche financée au moins pour moitié par des dotations de l'Etat, des collectivités territoriales ou des établissements publics, par des subventions d'agences de financement nationales ou par des fonds de l'Union européenne est publié dans un périodique paraissant au moins une fois par an, son auteur dispose, même après avoir accordé des droits exclusifs à un éditeur, du droit de mettre à disposition gratuitement dans un format ouvert, par voie numérique, sous réserve de l'accord des éventuels coauteurs, la version finale de son manuscrit acceptée pour publication, dès lors que l'éditeur met lui-même celle-ci gratuitement à disposition par voie numérique ou, à défaut, à l'expiration d'un délai courant à compter de la date de la première publication. Ce délai est au maximum de six mois pour une publication dans le domaine des sciences, de la technique et de la médecine et de douze mois dans celui des sciences humaines et sociales. »

Un autre article de cette loi concerne également le libre accès, l’article 38 sur la fouille de textes et de données. Il sera effectif lorsque les décrets d’application auront été publiés.

Source : Bibliothèque universitaire Pierre et Marie Curie (France)

France : libre accès aux articles scientifiques !

Intermède : Pina Bausch

12 Octobre 2016,

Publié par JMB

A travers ce film en 3D, "Pina", Wim Wenders a voulu rendre hommage a Pina Bausch, danseuse et chorégraphe de danse contemporaine et initiatrice du style danse-théâtre. Le défi était grand. En effet, comment filmer la danse ? L'émotion transmise par les danseurs à travers leurs corps, leurs mouvements, leurs souffles, leurs échanges... In fine, un merveilleux film.

Dans ce film, les danseurs et danseuses appartiennent à la compagnie Tanztheater Wuppertal fondée par Pina Bausch. Un extrait ci-dessous. Dans ce passage, la musique est de Jun Miyake, il s'agit du morceau intitulé "Lilies in the Valley".

"Dansez, dansez... sinon nous sommes perdus" (Pina Bausch, 1940-2009).

 

 

Vladimir Nabokov raconté par Jean-Claude Ameisen

8 Octobre 2016,

Publié par Bioécologie

Je vous propose d'écouter une des merveilleuses émissions radio de Jean-Claude Ameisen diffusée le 14 mai 2011 sur les ondes de France inter : A la recherche des mystères de l'hérédité (4) - Quand l'art rencontre la science

 

Vladimir-Nabokov.jpgDécouvrez à travers cette émission les travaux de Vladimir Nabokov sur les papillons, et bien plus…

 

« L’histoire de Nabokov peut nous apprendre quelque chose d’important sur l’unité de la créativité, et l’erreur qu’il y a dans notre façon traditionnelle de séparer art et science ». Stephen Jay Gould (in english: here).

 

 

 

 

 

 

 

Vladimir Nabokov, Butterfly Hunter.  (Ithica, NY, 1958; photograph by Carl Mydans)

 

Une découverte, 1943

Je le trouvai et le nommai,

étant versé dans le latin des classifications ;

Ainsi je devins le parrain d’un papillon, et le

premier à le décrire.

Et je ne veux pas d’autre gloire.

[…]

Il transcendera (ce papillon) sa poussière.

De sombres tableaux, des trônes, les statues

qu’embrassent les pèlerins,

les poèmes qui mettent des milliers d’années à

mourir,

ne font que singer l’immortalité de cette

étiquette rouge sur un petit papillon.

 

Vladimir Nabokov (1899-1977)

Le monde des bulles : quand les sciences rejoignent l'art !

7 Octobre 2016,

Publié par JMB

Thomas Séon et Arnaud Antkowiak (Institut Jean Le Rond d'Alembert) ont vu en 2011 leurs travaux récompensés par le prix "le Goût des sciences" catégorie "les chercheurs communiquent". Le jury a en effet été conquis par leur petit film de bulles visqueuses qui montrent des séquences issues de leurs expériences. 

 

Thomas Séon et Arnaud Antkowiak travaillent sur la dynamique des jets dans les bulles. Pour ce faire, ils ont construit un aquarium rempli d’un liquide visqueux dans lequel un dispositif permet d’injecter de l’air et de former des bulles. A l’aide d’une caméra rapide équipée d’un objectif macroscopique, ils filment le phénomène et l’étudient ensuite au ralenti.

Leur domaine d’étude porte, au-delà des images, sur des problématiques bien concrètes comme l’impact des gouttes de pluie sur l’érosion ou en informatique pour les imprimantes à jet d’encre, par exemple.

Source : Sciences et Avenir.fr

Pour en savoir plus : cette vidéo est issue d'un travail scientifique publié dans la revue Physics of Fluid : T. Séon and A. Antkowiak, Jets in viscous bubbles, phys. Fluids 23, 2011

La musique est du groupe Team Gohst. Ce clip vidéo a été co-réalisé par Romain Glé (16argarden) et Thomas Séon. Il accompagne le morceau “High Hopes” du groupe Team Ghost. Les bulles ont été filmées à l'aide d'une caméra à haute vitesse Photron SA-5 à 7000 fps.

The European amphioxus (Branchiostoma lanceolatum)

7 Octobre 2016,

Publié par Bioécologie

Insights into spawning behavior and development of the European amphioxus (Branchiostoma lanceolatum).

Fuentes M1, Benito E, Bertrand S, Paris M, Mignardot A, Godoy L, Jimenez-Delgado S, Oliveri D, Candiani S, Hirsinger E, D'Aniello S, Pascual-Anaya J, Maeso I, Pestarino M, Vernier P, Nicolas JF, Schubert M, Laudet V, Geneviere AM, Albalat R, Garcia Fernandez J, Holland ND, Escriva H.

1Laboratoire Arago, UMR7628 CNRS, University Pierre and Marie Curie-Paris6 Banyuls sur Mer, F-66650, France.
Abstract

The cephalochordate amphioxus (Branchiostoma sp.) is an important animal model for studying the evolution of chordate developmental mechanisms. Obtaining amphioxus embryos is a key step for these studies. It has been shown that an increase of 3-4 degrees C in water temperature triggers spawning of the European amphioxus (Branchiostoma lanceolatum) in captivity, however, very little is known about the natural spawning behavior of this species in the field. In this work, we have followed the spawning behavior of the European amphioxus during two spawning seasons (2004 and 2005), both in the field and in captivity. We show that animals in the field spawn approximately from mid-May through early July, but depending on the year, they show different patterns of spawning. Thus, even if temperature has a critical role in the induction of the spawning in captivity, it is not the major factor in the field. Moreover, we report some improvements on the methodology for inducing spawning in captivity (e.g. in maintenance, light cycle control and induction of spawning in a laboratory without running sea water system). These studies have important implications for amphioxus animal husbandry and for improving laboratory techniques to develop amphioxus as an experimental animal model.

Download the publication here