Offre de doctorat : les diatomées, bioindicateurs des écosystèmes aquatiques

Barcoding et Biomonitoring : développement d’outils innovants de bioindication des écosystèmes aquatiques basés sur les diatomées et sur les nouvelles techniques de séquençage à haut-débit. Application à la bioindication de la qualité des cours d'eau de Mayotte.

L’objectif de ce doctorat (INRA, UMR CARRTEL, Thonon-les-Bains, et Asconit Consultants, Lyon, France) est de développer des outils moléculaires pour l’identification des diatomées afin d’améliorer l’utilisation de ces microorganismes comme bioindicateurs de la qualité des eaux. Ce travail s’inscrit dans le cadre général de l’application de la Directive Cadre Européenne sur l’Eau (évaluation de l’état écologique des masses d’eau) à Mayotte, à la demande de l'ONEMA (Office National des Eaux et des milieux aquatiques, France).

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Une diatomée grossie 1000 fois. Il s'agit de l'espèce Cymbella aspera (taille moyenne : 110 µm de long et 25 µm de large) - photo d'Olivier Herlory