Logiciels scientifiques, utilitaires gratuits

Lundi 3 août 2009

Si vous êtez amenés à prendre des photos scientifiques (ou autres), voici quelques logiciels et utilitaires gratuits pour le traitement de vos photos (Source : Argus-Photo.fr). Les photos qui illustrent cet article sont de © J-M Bonzom.

Pc Inspector smart recovery : Ce logiciel est un secouriste des images perdues. Il permet de récupérer des images sur la carte-mémoire, même si celle-ci a été effacée ou reformattée.

Photofiltre : Un excellent logiciel de traitement de photos. Nombreux filtres, cadres, polices de texte et effets sur les polices...

IrfanView : Célèbre visionneuse, très complète. Complète idéalement Photofiltre, d'autant qu'il existe un additif pour la langue française (cet additif n'est pas sur le site officiel).

XN View : Visionneuse, gratuiciel, en francais. Permet de créer des bibliothèques ou des pages web, des photoramas (diaporamas de photo = photoramas) etc.

11view : Visionneuse d'image. Ce serait presque le compagnon idéal de Photofiltre !

Coffe Cup Image viewer : Visionneuse.

Opanda Photofilter : Photofilter, à ne pas confondre avec photofiltre, se limite aux filtres de couleurs, tels ceux que l'on ajoute à nos objectifs. On trouve ainsi l'équivalent des filtres Kodak, Cokin et Hoya. En tout, une centaine de filtres.

Exif Manager : Logiciel de traitement des informations Exif. Gratuit, en francais et  en anglais. Permet de visualiser et mettre à jour les informations exif, d'y insérer un copyright, mais aussi de supprimer les informations Exif, par exemple avant tirage. Traitements par lot.

Exifer : Logiciel de traitement des informations Exif. Gratuit, mais en anglais.

Diaporama : Ce logiciel vous permet de réaliser facilement des présentations de vos photos sous forme de diaporama. Il est possible pour chaque image de régler le temps d'affichage, spécifier une bordure,  de choisir parmi 127 transition. Génère un fichier executable.

YoPoW : Logiciel de création de galerie de photos. Présente la particularité de permettre la mise en ligne sur Internet de la dite galerie.

Minigal : Logiciel de création de galerie de photos. Présente la particularité de permettre la mise en ligne sur Internet de la dite galerie.

Image Dupeless : Outil de recherche des images redondantes. Analyse l'image, et non pas seulement la taille ou le nom. Permet de faire le menage sur le disque dur.

Picture Shark : Applique un filigrane sur une ou une série d'images. Transparence ajustable.

Posteriza : Ce logiciel permet de générer des posters, c'est-à-dire qu'il découpe une photo en plusieurs pour permettre l'impression à un format donné.

Url2bmp : Création d'une image bmp à partir d'une adresse de page Internet (URL). Interessant, car ce n'est pas évident de le faire en copie d'écran si la page est plus grande que l'écran.

Patchwork Maker : Inattendu ! Un logiciel créant une image patchwork (assemble de mini-morceaux) à partir d'un ensemble (important) d'images. Très puissant, même s'il est d'une utilité limitée.

Foto-Mosaik : Logciel permettant de créer une image mosaïque partir de nombreuses autres images.

Gif Optimizer : Logiciel pour optimiser la taille des fichiers gif, animés ou non.

Par JMB
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Dimanche 2 août 2009

Author : Dr Stéphane Gasparini; Laboratoire d'Océanographie de Villefranche; UMR 7093 - CNRS / Université Pierre et Marie Curie - Paris 6; BP 28 - 06234 Villefranche sur mer Cedex - France


Presentation

Plankton Identifier is a free software which allows the automatic identification of objects (plankton and/or particles) from a set of images with their associated data. Therefore, before you can use Plankton Identifier, you must extract object data (PID format) and object thumbnails (JPEG format) with a dedicated hardware-software combination such as ZooScan and ZooProcess (http://www.ZooScan.com).

Once data acquisition is done, Plankton Identifier helps the user to build a Learning File (set of objects identified by an expert) through a safe interface which prevents from data loss, erroneous duplicates etc. Then, using the learning file, Plankton Identifier allows the automatic recognition of an unlimited number of objects from one or several data files. Additionally, the user can optimize the recognition by many ways (by choice of different data analysis methods, selection of variables, variable transformation, way of grouping objects etc.). Results are stored in one or several text files which can easily be imported in other softwares (for graphics, time series analysis etc...). A detailed statistical report is also generated (html format allowing copy-paste).

NOTE: Although Plankton Identifier has been initially developed to identify Planktonic organisms, it can virtually identify any kind of objects.

Supervised learning algorithms are not implemented in Plankton Identifier itself but are those of the free data mining software TANAGRA which is used in batch mode. This is the reason why you must install Tanagra 1.4.22 or above on your computer before using Plankton Identifier.

TANAGRA can be downloaded here.

NOTE: Experimented users can define their own data analysis methods for Plankton Identifier using Tanagra tdm format.

Par JMB
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Vendredi 12 juin 2009

Vous souhaiter déterminer une date de réunion entre collègues, amis, etc. Fixer une date de soutenance de thèse qui convienne à tous les membres du jury, etc. Voici un utilitaire simple et fort partique. Cliquez ici


Vous souhaitez envoyer un rapport volumineux, etc. Il est trop "lourd" pour l'envoyer par email. Voici une solution très simple : passez par YOUSENDit. C'est vraiment très simple d'utilisation. Cliquez ici

Par JMB
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Jeudi 5 mars 2009

Vous avez une photo d'un organisme, d'une cellule,...et vous souhaitez réaliser diverses mesures (longueur, surface,...), je vous conseille ce logiciel : ImageJ

ImageJ est un logiciel libre d’analyse et de traitement d’images, inspiré à l’origine du logiciel NIH Image pour Macintosh.

Un certain nombre de traitements d’images basiques sont disponibles par défaut : seuillage, convolutions, morphologie mathématique, comptage d’objets…

 

Par JMB
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Mardi 25 novembre 2008

1. PLUME
un site Internet pour Promouvoir les Logiciels Utiles Maîtrisés et Economiques dans l'Enseignement Supérieur et la Recherche (universités,
CNRS, INRA...) : http://www.projet-plume.org/

 Une multitude de logiciels gratuits et surtout validés !

2. Morphometric measurements
Thank you 
Richard Palmer (University of Alberta, Canada)

  • Palmer, A. R. 1992, 1994.
    ExCaliper: Captures data from digital calipers onto a Macintosh computer.

     

  • Palmer, A. R. 1996.
    MacCoil: Displays wire-frame images of coiled mollusc shells drawn using user-specified ('point-and-click') coiling parameters on a Macintosh computer.

     

  • Links to other morphometric software.

3. Un logiciel gratuit pour réaliser des analyses de puissances : G*Power
G*Power 3 is a statistical power analysis program for MacOS X 10.4 and Windows XP/Vista. It is a major extension of, and improvement over, the previous version, covering many different statistical tests of the F, t, chi-square, and z test families as well as some exact tests. G*Power 3 provides improved effect size calculators and graphics options, it supports both a distribution-based and a design-based input mode, and it offers five different types of power analyses. Like its predecessors, G*Power 3 is free.
Download and register G*Power 3
Par JMB
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